Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF7P17544 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF7P17544 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF7P17544 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF7P17544 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF7P17544 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF7P17544 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF7P17544 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF7P17544 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATF7P17544 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATF7P17544 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATF7P17544 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATF7P17544 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATF7P17544 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATF7P17544 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATF7P17544 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATF7P17544 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATF7P17544 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATF7P17544 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATF7P17544 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATF7P17544 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATF7P17544 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATF7P17544 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATF7P17544 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATF7P17544 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATF7P17544 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATF7P17544 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATF7P17544 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATF7P17544 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATF7P17544 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ATF7P17544 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ATF7P17544 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ATF7P17544 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATF7P17544 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATF7P17544 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATF7P17544 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATF7P17544 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF7P17544 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF7P17544 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF7P17544 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF7P17544 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF7P17544 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF7P17544 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF7P17544 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF7P17544 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF7P17544 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF7P17544 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF7P17544 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF7P17544 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF7P17544 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF7P17544 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF7P17544 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF7P17544 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF7P17544 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF7P17544 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF7P17544 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF7P17544 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF7P17544 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF7P17544 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF7P17544 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF7P17544 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF7P17544 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF7P17544 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF7P17544 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF7P17544 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATF7P17544 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATF7P17544 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATF7P17544 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATF7P17544 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATF7P17544 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATF7P17544 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATF7P17544 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATF7P17544 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATF7P17544 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATF7P17544 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATF7P17544 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATF7P17544 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATF7P17544 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATF7P17544 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATF7P17544 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATF7P17544 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATF7P17544 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATF7P17544 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATF7P17544 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATF7P17544 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATF7P17544 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATF7P17544 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATF7P17544 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATF7P17544 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF7P17544 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF7P17544 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF7P17544 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF7P17544 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF7P17544 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF7P17544 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF7P17544 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF7P17544 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF7P17544 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF7P17544 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF7P17544 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms