Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRAFP15056 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BRAFP15056 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BRAFP15056 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BRAFP15056 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BRAFP15056 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BRAFP15056 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRAFP15056 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRAFP15056 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRAFP15056 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
BRAFP15056 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRAFP15056 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRAFP15056 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRAFP15056 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRAFP15056 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRAFP15056 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRAFP15056 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRAFP15056 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BRAFP15056 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BRAFP15056 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRAFP15056 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRAFP15056 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRAFP15056 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRAFP15056 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRAFP15056 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRAFP15056 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BRAFP15056 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRAFP15056 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRAFP15056 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRAFP15056 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRAFP15056 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRAFP15056 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRAFP15056 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRAFP15056 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRAFP15056 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRAFP15056 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRAFP15056 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRAFP15056 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRAFP15056 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRAFP15056 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRAFP15056 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRAFP15056 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRAFP15056 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRAFP15056 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRAFP15056 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRAFP15056 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRAFP15056 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRAFP15056 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRAFP15056 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRAFP15056 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRAFP15056 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRAFP15056 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRAFP15056 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRAFP15056 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRAFP15056 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRAFP15056 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRAFP15056 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRAFP15056 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRAFP15056 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRAFP15056 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRAFP15056 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRAFP15056 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRAFP15056 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRAFP15056 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BRAFP15056 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRAFP15056 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRAFP15056 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRAFP15056 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRAFP15056 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRAFP15056 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRAFP15056 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRAFP15056 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRAFP15056 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRAFP15056 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRAFP15056 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRAFP15056 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRAFP15056 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRAFP15056 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRAFP15056 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRAFP15056 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRAFP15056 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRAFP15056 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRAFP15056 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRAFP15056 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRAFP15056 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRAFP15056 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRAFP15056 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRAFP15056 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRAFP15056 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRAFP15056 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRAFP15056 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRAFP15056 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRAFP15056 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRAFP15056 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRAFP15056 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRAFP15056 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRAFP15056 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRAFP15056 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRAFP15056 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRAFP15056 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms