Protein–RNA interactions for Protein: P11171

EPB41, Protein 4.1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41P11171 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPB41P11171 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPB41P11171 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPB41P11171 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
EPB41P11171 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPB41P11171 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPB41P11171 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPB41P11171 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPB41P11171 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPB41P11171 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPB41P11171 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EPB41P11171 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EPB41P11171 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EPB41P11171 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPB41P11171 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EPB41P11171 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPB41P11171 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPB41P11171 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPB41P11171 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPB41P11171 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPB41P11171 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPB41P11171 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPB41P11171 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPB41P11171 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPB41P11171 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPB41P11171 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPB41P11171 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EPB41P11171 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPB41P11171 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41P11171 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41P11171 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41P11171 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41P11171 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41P11171 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41P11171 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41P11171 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41P11171 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41P11171 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41P11171 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41P11171 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41P11171 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41P11171 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41P11171 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41P11171 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41P11171 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41P11171 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41P11171 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41P11171 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41P11171 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41P11171 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41P11171 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41P11171 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41P11171 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41P11171 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41P11171 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41P11171 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41P11171 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41P11171 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41P11171 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41P11171 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41P11171 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41P11171 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41P11171 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41P11171 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41P11171 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41P11171 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB41P11171 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB41P11171 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB41P11171 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB41P11171 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB41P11171 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB41P11171 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41P11171 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41P11171 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41P11171 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41P11171 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41P11171 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41P11171 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41P11171 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41P11171 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41P11171 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41P11171 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41P11171 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41P11171 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EPB41P11171 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPB41P11171 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPB41P11171 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPB41P11171 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPB41P11171 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPB41P11171 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPB41P11171 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPB41P11171 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPB41P11171 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPB41P11171 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPB41P11171 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPB41P11171 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPB41P11171 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPB41P11171 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPB41P11171 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPB41P11171 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms