Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms