Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RD3LP0DJH9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms