Protein–RNA interactions for Protein: P0C7H9

USP17L7, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L7P0C7H9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L7P0C7H9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L7P0C7H9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L7P0C7H9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L7P0C7H9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L7P0C7H9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L7P0C7H9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L7P0C7H9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L7P0C7H9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L7P0C7H9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L7P0C7H9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L7P0C7H9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L7P0C7H9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L7P0C7H9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L7P0C7H9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L7P0C7H9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L7P0C7H9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L7P0C7H9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L7P0C7H9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L7P0C7H9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L7P0C7H9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L7P0C7H9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L7P0C7H9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L7P0C7H9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L7P0C7H9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP17L7P0C7H9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP17L7P0C7H9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L7P0C7H9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms