Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CT47B1P0C2W7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CT47B1P0C2W7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms