Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms