Protein–RNA interactions for Protein: P09326

CD48, CD48 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD48P09326 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CD48P09326 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD48P09326 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CD48P09326 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CD48P09326 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CD48P09326 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD48P09326 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CD48P09326 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD48P09326 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD48P09326 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CD48P09326 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD48P09326 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD48P09326 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD48P09326 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD48P09326 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD48P09326 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD48P09326 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD48P09326 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD48P09326 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD48P09326 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD48P09326 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD48P09326 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CD48P09326 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CD48P09326 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CD48P09326 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CD48P09326 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD48P09326 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD48P09326 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD48P09326 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD48P09326 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD48P09326 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD48P09326 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD48P09326 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD48P09326 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD48P09326 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CD48P09326 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CD48P09326 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CD48P09326 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CD48P09326 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CD48P09326 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD48P09326 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD48P09326 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD48P09326 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD48P09326 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD48P09326 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD48P09326 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD48P09326 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD48P09326 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD48P09326 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD48P09326 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD48P09326 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD48P09326 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD48P09326 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD48P09326 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD48P09326 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD48P09326 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD48P09326 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD48P09326 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD48P09326 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD48P09326 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD48P09326 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD48P09326 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD48P09326 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD48P09326 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CD48P09326 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD48P09326 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD48P09326 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD48P09326 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD48P09326 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD48P09326 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD48P09326 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD48P09326 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD48P09326 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD48P09326 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD48P09326 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD48P09326 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD48P09326 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD48P09326 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD48P09326 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CD48P09326 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD48P09326 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CD48P09326 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD48P09326 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD48P09326 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD48P09326 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD48P09326 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD48P09326 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD48P09326 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD48P09326 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD48P09326 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD48P09326 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CD48P09326 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD48P09326 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD48P09326 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD48P09326 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD48P09326 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD48P09326 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD48P09326 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD48P09326 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD48P09326 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms