Protein–RNA interactions for Protein: P08684

CYP3A4, Cytochrome P450 3A4, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP3A4P08684 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYP3A4P08684 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYP3A4P08684 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CYP3A4P08684 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CYP3A4P08684 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CYP3A4P08684 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYP3A4P08684 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYP3A4P08684 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYP3A4P08684 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYP3A4P08684 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYP3A4P08684 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYP3A4P08684 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYP3A4P08684 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYP3A4P08684 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYP3A4P08684 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYP3A4P08684 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYP3A4P08684 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYP3A4P08684 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYP3A4P08684 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYP3A4P08684 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYP3A4P08684 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYP3A4P08684 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYP3A4P08684 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYP3A4P08684 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CYP3A4P08684 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYP3A4P08684 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYP3A4P08684 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYP3A4P08684 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYP3A4P08684 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYP3A4P08684 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYP3A4P08684 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYP3A4P08684 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYP3A4P08684 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYP3A4P08684 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYP3A4P08684 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYP3A4P08684 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms