Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms