Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI1P08151 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI1P08151 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI1P08151 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI1P08151 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI1P08151 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI1P08151 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI1P08151 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI1P08151 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI1P08151 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI1P08151 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI1P08151 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI1P08151 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI1P08151 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI1P08151 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI1P08151 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI1P08151 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI1P08151 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI1P08151 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI1P08151 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI1P08151 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI1P08151 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI1P08151 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI1P08151 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI1P08151 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI1P08151 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI1P08151 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI1P08151 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI1P08151 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI1P08151 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI1P08151 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI1P08151 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI1P08151 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GLI1P08151 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GLI1P08151 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GLI1P08151 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI1P08151 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI1P08151 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI1P08151 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI1P08151 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI1P08151 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI1P08151 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI1P08151 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI1P08151 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI1P08151 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI1P08151 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI1P08151 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI1P08151 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI1P08151 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI1P08151 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI1P08151 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI1P08151 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI1P08151 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI1P08151 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI1P08151 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI1P08151 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI1P08151 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI1P08151 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI1P08151 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI1P08151 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI1P08151 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI1P08151 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI1P08151 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI1P08151 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI1P08151 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI1P08151 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI1P08151 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI1P08151 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI1P08151 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI1P08151 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI1P08151 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI1P08151 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI1P08151 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI1P08151 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI1P08151 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI1P08151 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI1P08151 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI1P08151 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI1P08151 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI1P08151 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI1P08151 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI1P08151 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI1P08151 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI1P08151 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
GLI1P08151 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
GLI1P08151 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GLI1P08151 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GLI1P08151 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GLI1P08151 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GLI1P08151 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GLI1P08151 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLI1P08151 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLI1P08151 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLI1P08151 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLI1P08151 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLI1P08151 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLI1P08151 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLI1P08151 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GLI1P08151 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GLI1P08151 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms