Protein–RNA interactions for Protein: P05937

CALB1, Calbindin, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB1P05937 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALB1P05937 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALB1P05937 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALB1P05937 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALB1P05937 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALB1P05937 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALB1P05937 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALB1P05937 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALB1P05937 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALB1P05937 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALB1P05937 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALB1P05937 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALB1P05937 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALB1P05937 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALB1P05937 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALB1P05937 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALB1P05937 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALB1P05937 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALB1P05937 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALB1P05937 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALB1P05937 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CALB1P05937 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALB1P05937 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALB1P05937 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALB1P05937 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALB1P05937 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALB1P05937 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALB1P05937 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALB1P05937 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALB1P05937 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALB1P05937 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALB1P05937 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALB1P05937 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CALB1P05937 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALB1P05937 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALB1P05937 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALB1P05937 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALB1P05937 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CALB1P05937 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CALB1P05937 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALB1P05937 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALB1P05937 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALB1P05937 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALB1P05937 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALB1P05937 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALB1P05937 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALB1P05937 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALB1P05937 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALB1P05937 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CALB1P05937 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALB1P05937 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALB1P05937 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALB1P05937 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALB1P05937 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALB1P05937 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALB1P05937 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALB1P05937 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALB1P05937 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALB1P05937 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALB1P05937 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALB1P05937 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALB1P05937 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALB1P05937 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALB1P05937 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALB1P05937 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALB1P05937 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALB1P05937 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALB1P05937 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALB1P05937 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALB1P05937 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALB1P05937 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CALB1P05937 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALB1P05937 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALB1P05937 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALB1P05937 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALB1P05937 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALB1P05937 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALB1P05937 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALB1P05937 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALB1P05937 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALB1P05937 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CALB1P05937 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CALB1P05937 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CALB1P05937 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CALB1P05937 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CALB1P05937 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALB1P05937 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALB1P05937 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALB1P05937 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALB1P05937 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALB1P05937 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALB1P05937 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALB1P05937 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALB1P05937 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALB1P05937 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALB1P05937 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALB1P05937 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALB1P05937 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALB1P05937 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALB1P05937 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms