Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYBBP04839 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYBBP04839 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYBBP04839 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYBBP04839 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYBBP04839 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYBBP04839 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CYBBP04839 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYBBP04839 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYBBP04839 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYBBP04839 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYBBP04839 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYBBP04839 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYBBP04839 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYBBP04839 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYBBP04839 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYBBP04839 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYBBP04839 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYBBP04839 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYBBP04839 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYBBP04839 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYBBP04839 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYBBP04839 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYBBP04839 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYBBP04839 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYBBP04839 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYBBP04839 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYBBP04839 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYBBP04839 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYBBP04839 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYBBP04839 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CYBBP04839 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CYBBP04839 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYBBP04839 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYBBP04839 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYBBP04839 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYBBP04839 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYBBP04839 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYBBP04839 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYBBP04839 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CYBBP04839 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYBBP04839 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYBBP04839 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYBBP04839 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYBBP04839 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYBBP04839 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYBBP04839 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYBBP04839 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYBBP04839 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYBBP04839 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYBBP04839 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYBBP04839 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYBBP04839 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYBBP04839 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYBBP04839 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYBBP04839 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CYBBP04839 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYBBP04839 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYBBP04839 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYBBP04839 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYBBP04839 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYBBP04839 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYBBP04839 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CYBBP04839 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CYBBP04839 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYBBP04839 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYBBP04839 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYBBP04839 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYBBP04839 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYBBP04839 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYBBP04839 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYBBP04839 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYBBP04839 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYBBP04839 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYBBP04839 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYBBP04839 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CYBBP04839 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYBBP04839 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYBBP04839 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYBBP04839 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYBBP04839 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYBBP04839 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYBBP04839 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYBBP04839 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYBBP04839 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYBBP04839 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYBBP04839 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYBBP04839 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYBBP04839 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYBBP04839 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYBBP04839 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYBBP04839 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYBBP04839 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CYBBP04839 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYBBP04839 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYBBP04839 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYBBP04839 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYBBP04839 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYBBP04839 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYBBP04839 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms