Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYCNP04198 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYCNP04198 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYCNP04198 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MYCNP04198 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYCNP04198 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYCNP04198 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYCNP04198 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYCNP04198 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYCNP04198 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYCNP04198 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYCNP04198 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYCNP04198 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYCNP04198 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYCNP04198 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYCNP04198 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYCNP04198 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYCNP04198 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYCNP04198 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MYCNP04198 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYCNP04198 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MYCNP04198 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYCNP04198 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MYCNP04198 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYCNP04198 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYCNP04198 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYCNP04198 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYCNP04198 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MYCNP04198 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYCNP04198 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYCNP04198 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MYCNP04198 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYCNP04198 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MYCNP04198 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYCNP04198 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYCNP04198 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYCNP04198 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYCNP04198 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYCNP04198 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYCNP04198 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYCNP04198 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYCNP04198 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYCNP04198 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYCNP04198 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYCNP04198 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYCNP04198 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYCNP04198 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYCNP04198 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MYCNP04198 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MYCNP04198 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MYCNP04198 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MYCNP04198 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MYCNP04198 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MYCNP04198 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MYCNP04198 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MYCNP04198 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MYCNP04198 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MYCNP04198 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MYCNP04198 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MYCNP04198 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYCNP04198 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYCNP04198 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYCNP04198 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYCNP04198 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYCNP04198 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYCNP04198 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYCNP04198 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYCNP04198 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYCNP04198 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MYCNP04198 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MYCNP04198 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYCNP04198 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYCNP04198 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYCNP04198 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYCNP04198 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYCNP04198 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYCNP04198 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYCNP04198 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYCNP04198 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYCNP04198 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYCNP04198 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYCNP04198 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYCNP04198 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYCNP04198 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYCNP04198 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MYCNP04198 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYCNP04198 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYCNP04198 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYCNP04198 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYCNP04198 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYCNP04198 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYCNP04198 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYCNP04198 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYCNP04198 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYCNP04198 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYCNP04198 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYCNP04198 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYCNP04198 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYCNP04198 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MYCNP04198 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms