Protein–RNA interactions for Protein: P02748

C9, Complement component C9, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P02748 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C9P02748 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9P02748 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C9P02748 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9P02748 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9P02748 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9P02748 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9P02748 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9P02748 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9P02748 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9P02748 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9P02748 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C9P02748 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9P02748 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9P02748 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9P02748 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9P02748 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9P02748 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9P02748 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9P02748 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9P02748 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9P02748 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9P02748 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9P02748 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9P02748 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9P02748 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9P02748 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9P02748 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9P02748 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9P02748 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9P02748 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9P02748 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9P02748 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9P02748 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9P02748 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9P02748 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9P02748 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9P02748 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9P02748 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9P02748 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9P02748 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9P02748 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9P02748 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9P02748 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9P02748 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9P02748 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C9P02748 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C9P02748 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C9P02748 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C9P02748 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C9P02748 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C9P02748 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C9P02748 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9P02748 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9P02748 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9P02748 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9P02748 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9P02748 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9P02748 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9P02748 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9P02748 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9P02748 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9P02748 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9P02748 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9P02748 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C9P02748 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9P02748 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9P02748 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9P02748 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9P02748 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C9P02748 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9P02748 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9P02748 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9P02748 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9P02748 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9P02748 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9P02748 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9P02748 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9P02748 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9P02748 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9P02748 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9P02748 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9P02748 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9P02748 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9P02748 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9P02748 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9P02748 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9P02748 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9P02748 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9P02748 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9P02748 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C9P02748 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9P02748 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9P02748 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9P02748 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9P02748 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9P02748 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9P02748 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9P02748 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9P02748 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms