Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC4A1P02730 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms