Protein–RNA interactions for Protein: P01133

EGF, Pro-epidermal growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFP01133 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EGFP01133 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EGFP01133 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EGFP01133 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EGFP01133 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EGFP01133 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EGFP01133 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EGFP01133 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EGFP01133 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EGFP01133 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EGFP01133 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EGFP01133 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EGFP01133 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EGFP01133 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EGFP01133 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EGFP01133 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EGFP01133 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EGFP01133 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EGFP01133 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EGFP01133 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EGFP01133 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EGFP01133 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EGFP01133 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EGFP01133 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EGFP01133 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EGFP01133 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EGFP01133 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EGFP01133 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EGFP01133 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EGFP01133 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EGFP01133 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EGFP01133 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EGFP01133 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EGFP01133 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EGFP01133 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EGFP01133 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EGFP01133 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EGFP01133 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EGFP01133 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EGFP01133 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EGFP01133 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EGFP01133 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EGFP01133 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EGFP01133 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EGFP01133 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EGFP01133 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EGFP01133 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EGFP01133 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EGFP01133 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EGFP01133 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EGFP01133 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EGFP01133 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EGFP01133 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EGFP01133 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EGFP01133 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EGFP01133 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EGFP01133 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EGFP01133 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EGFP01133 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EGFP01133 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EGFP01133 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EGFP01133 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EGFP01133 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EGFP01133 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EGFP01133 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EGFP01133 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EGFP01133 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EGFP01133 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EGFP01133 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EGFP01133 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EGFP01133 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EGFP01133 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EGFP01133 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EGFP01133 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EGFP01133 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EGFP01133 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EGFP01133 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EGFP01133 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EGFP01133 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EGFP01133 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EGFP01133 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EGFP01133 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EGFP01133 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EGFP01133 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EGFP01133 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EGFP01133 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EGFP01133 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EGFP01133 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EGFP01133 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EGFP01133 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EGFP01133 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EGFP01133 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EGFP01133 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EGFP01133 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EGFP01133 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EGFP01133 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EGFP01133 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EGFP01133 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EGFP01133 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EGFP01133 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms