Protein–RNA interactions for Protein: P01040

CSTA, Cystatin-A, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTAP01040 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSTAP01040 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSTAP01040 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSTAP01040 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSTAP01040 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSTAP01040 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSTAP01040 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSTAP01040 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSTAP01040 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSTAP01040 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSTAP01040 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSTAP01040 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSTAP01040 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CSTAP01040 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSTAP01040 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSTAP01040 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CSTAP01040 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSTAP01040 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CSTAP01040 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSTAP01040 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSTAP01040 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSTAP01040 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CSTAP01040 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSTAP01040 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSTAP01040 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSTAP01040 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSTAP01040 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSTAP01040 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSTAP01040 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSTAP01040 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSTAP01040 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSTAP01040 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSTAP01040 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSTAP01040 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSTAP01040 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSTAP01040 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSTAP01040 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSTAP01040 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSTAP01040 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSTAP01040 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSTAP01040 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSTAP01040 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSTAP01040 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSTAP01040 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSTAP01040 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSTAP01040 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSTAP01040 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSTAP01040 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSTAP01040 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSTAP01040 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSTAP01040 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSTAP01040 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSTAP01040 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CSTAP01040 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSTAP01040 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSTAP01040 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSTAP01040 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSTAP01040 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSTAP01040 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSTAP01040 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CSTAP01040 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSTAP01040 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSTAP01040 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSTAP01040 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSTAP01040 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSTAP01040 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSTAP01040 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSTAP01040 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CSTAP01040 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSTAP01040 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSTAP01040 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSTAP01040 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSTAP01040 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSTAP01040 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSTAP01040 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSTAP01040 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSTAP01040 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CSTAP01040 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSTAP01040 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CSTAP01040 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSTAP01040 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CSTAP01040 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSTAP01040 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSTAP01040 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CSTAP01040 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSTAP01040 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSTAP01040 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSTAP01040 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSTAP01040 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSTAP01040 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSTAP01040 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSTAP01040 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSTAP01040 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSTAP01040 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSTAP01040 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSTAP01040 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSTAP01040 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSTAP01040 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSTAP01040 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSTAP01040 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms