Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
F9P00740 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
F9P00740 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
F9P00740 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
F9P00740 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
F9P00740 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
F9P00740 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
F9P00740 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
F9P00740 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
F9P00740 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
F9P00740 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
F9P00740 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
F9P00740 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
F9P00740 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
F9P00740 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
F9P00740 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
F9P00740 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
F9P00740 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
F9P00740 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
F9P00740 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
F9P00740 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
F9P00740 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
F9P00740 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
F9P00740 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
F9P00740 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
F9P00740 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
F9P00740 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
F9P00740 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
F9P00740 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
F9P00740 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
F9P00740 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
F9P00740 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
F9P00740 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
F9P00740 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
F9P00740 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
F9P00740 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
F9P00740 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
F9P00740 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
F9P00740 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
F9P00740 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
F9P00740 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
F9P00740 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
F9P00740 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
F9P00740 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
F9P00740 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
F9P00740 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
F9P00740 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
F9P00740 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
F9P00740 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
F9P00740 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
F9P00740 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
F9P00740 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
F9P00740 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
F9P00740 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
F9P00740 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
F9P00740 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
F9P00740 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
F9P00740 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
F9P00740 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
F9P00740 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
F9P00740 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
F9P00740 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
F9P00740 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
F9P00740 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
F9P00740 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
F9P00740 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
F9P00740 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
F9P00740 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
F9P00740 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
F9P00740 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
F9P00740 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
F9P00740 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
F9P00740 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
F9P00740 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
F9P00740 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
F9P00740 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
F9P00740 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
F9P00740 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
F9P00740 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
F9P00740 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
F9P00740 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
F9P00740 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
F9P00740 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
F9P00740 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
F9P00740 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
F9P00740 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
F9P00740 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
F9P00740 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
F9P00740 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
F9P00740 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
F9P00740 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
F9P00740 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
F9P00740 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
F9P00740 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
F9P00740 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
F9P00740 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
F9P00740 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
F9P00740 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
F9P00740 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
F9P00740 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms