Protein–RNA interactions for Protein: P00488

F13A1, Coagulation factor XIII A chain, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13A1P00488 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
F13A1P00488 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
F13A1P00488 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
F13A1P00488 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
F13A1P00488 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
F13A1P00488 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
F13A1P00488 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
F13A1P00488 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
F13A1P00488 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
F13A1P00488 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
F13A1P00488 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
F13A1P00488 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
F13A1P00488 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
F13A1P00488 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
F13A1P00488 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
F13A1P00488 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
F13A1P00488 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
F13A1P00488 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
F13A1P00488 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
F13A1P00488 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
F13A1P00488 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
F13A1P00488 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
F13A1P00488 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
F13A1P00488 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
F13A1P00488 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
F13A1P00488 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
F13A1P00488 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
F13A1P00488 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
F13A1P00488 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
F13A1P00488 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
F13A1P00488 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
F13A1P00488 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
F13A1P00488 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
F13A1P00488 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
F13A1P00488 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
F13A1P00488 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
F13A1P00488 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
F13A1P00488 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
F13A1P00488 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
F13A1P00488 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
F13A1P00488 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
F13A1P00488 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
F13A1P00488 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
F13A1P00488 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
F13A1P00488 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
F13A1P00488 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
F13A1P00488 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
F13A1P00488 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
F13A1P00488 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
F13A1P00488 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
F13A1P00488 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
F13A1P00488 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
F13A1P00488 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
F13A1P00488 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
F13A1P00488 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
F13A1P00488 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
F13A1P00488 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
F13A1P00488 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
F13A1P00488 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
F13A1P00488 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
F13A1P00488 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
F13A1P00488 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
F13A1P00488 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
F13A1P00488 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
F13A1P00488 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
F13A1P00488 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
F13A1P00488 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
F13A1P00488 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
F13A1P00488 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
F13A1P00488 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
F13A1P00488 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
F13A1P00488 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
F13A1P00488 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
F13A1P00488 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
F13A1P00488 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
F13A1P00488 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
F13A1P00488 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
F13A1P00488 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
F13A1P00488 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
F13A1P00488 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
F13A1P00488 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
F13A1P00488 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
F13A1P00488 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
F13A1P00488 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
F13A1P00488 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
F13A1P00488 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
F13A1P00488 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
F13A1P00488 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
F13A1P00488 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
F13A1P00488 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
F13A1P00488 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
F13A1P00488 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
F13A1P00488 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
F13A1P00488 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
F13A1P00488 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
F13A1P00488 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
F13A1P00488 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
F13A1P00488 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
F13A1P00488 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
F13A1P00488 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms