Protein–RNA interactions for Protein: O95967

EFEMP2, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP2O95967 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EFEMP2O95967 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EFEMP2O95967 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EFEMP2O95967 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFEMP2O95967 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms