Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX7O95931 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX7O95931 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX7O95931 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX7O95931 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX7O95931 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX7O95931 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX7O95931 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX7O95931 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX7O95931 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX7O95931 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX7O95931 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX7O95931 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX7O95931 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX7O95931 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX7O95931 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX7O95931 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX7O95931 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX7O95931 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX7O95931 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX7O95931 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX7O95931 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX7O95931 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX7O95931 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX7O95931 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX7O95931 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX7O95931 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX7O95931 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX7O95931 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX7O95931 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX7O95931 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX7O95931 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX7O95931 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX7O95931 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX7O95931 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX7O95931 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX7O95931 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX7O95931 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX7O95931 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX7O95931 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX7O95931 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX7O95931 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX7O95931 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX7O95931 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX7O95931 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX7O95931 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX7O95931 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX7O95931 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX7O95931 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX7O95931 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX7O95931 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX7O95931 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX7O95931 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX7O95931 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX7O95931 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX7O95931 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX7O95931 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX7O95931 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX7O95931 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX7O95931 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX7O95931 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX7O95931 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX7O95931 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX7O95931 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX7O95931 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX7O95931 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX7O95931 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX7O95931 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX7O95931 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX7O95931 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX7O95931 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX7O95931 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX7O95931 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX7O95931 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX7O95931 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX7O95931 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX7O95931 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX7O95931 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX7O95931 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX7O95931 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX7O95931 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX7O95931 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX7O95931 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX7O95931 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX7O95931 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX7O95931 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX7O95931 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX7O95931 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX7O95931 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX7O95931 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX7O95931 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX7O95931 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CBX7O95931 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CBX7O95931 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX7O95931 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX7O95931 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX7O95931 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX7O95931 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX7O95931 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX7O95931 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms