Protein–RNA interactions for Protein: O95727

CRTAM, Cytotoxic and regulatory T-cell molecule, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAMO95727 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRTAMO95727 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRTAMO95727 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRTAMO95727 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRTAMO95727 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRTAMO95727 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRTAMO95727 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRTAMO95727 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRTAMO95727 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRTAMO95727 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRTAMO95727 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRTAMO95727 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRTAMO95727 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRTAMO95727 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRTAMO95727 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRTAMO95727 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRTAMO95727 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRTAMO95727 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRTAMO95727 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRTAMO95727 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRTAMO95727 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRTAMO95727 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRTAMO95727 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms