Protein–RNA interactions for Protein: O95718

ESRRB, Steroid hormone receptor ERR2, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRBO95718 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ESRRBO95718 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ESRRBO95718 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ESRRBO95718 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ESRRBO95718 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ESRRBO95718 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ESRRBO95718 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ESRRBO95718 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ESRRBO95718 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ESRRBO95718 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ESRRBO95718 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ESRRBO95718 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ESRRBO95718 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ESRRBO95718 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ESRRBO95718 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ESRRBO95718 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ESRRBO95718 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ESRRBO95718 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ESRRBO95718 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ESRRBO95718 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ESRRBO95718 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ESRRBO95718 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ESRRBO95718 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ESRRBO95718 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ESRRBO95718 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ESRRBO95718 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ESRRBO95718 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ESRRBO95718 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ESRRBO95718 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ESRRBO95718 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ESRRBO95718 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ESRRBO95718 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ESRRBO95718 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ESRRBO95718 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ESRRBO95718 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ESRRBO95718 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ESRRBO95718 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ESRRBO95718 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ESRRBO95718 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ESRRBO95718 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ESRRBO95718 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ESRRBO95718 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ESRRBO95718 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ESRRBO95718 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ESRRBO95718 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ESRRBO95718 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ESRRBO95718 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms