Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
STAMBPO95630 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms