Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTDNEP1O95476 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTDNEP1O95476 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms