Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAPBO95292 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VAPBO95292 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAPBO95292 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAPBO95292 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAPBO95292 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAPBO95292 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VAPBO95292 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VAPBO95292 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAPBO95292 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAPBO95292 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAPBO95292 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAPBO95292 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAPBO95292 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAPBO95292 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAPBO95292 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAPBO95292 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAPBO95292 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAPBO95292 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAPBO95292 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAPBO95292 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAPBO95292 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAPBO95292 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAPBO95292 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAPBO95292 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAPBO95292 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAPBO95292 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VAPBO95292 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VAPBO95292 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VAPBO95292 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAPBO95292 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAPBO95292 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAPBO95292 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAPBO95292 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAPBO95292 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAPBO95292 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAPBO95292 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAPBO95292 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VAPBO95292 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VAPBO95292 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAPBO95292 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VAPBO95292 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAPBO95292 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAPBO95292 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAPBO95292 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAPBO95292 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAPBO95292 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAPBO95292 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VAPBO95292 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAPBO95292 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAPBO95292 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAPBO95292 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAPBO95292 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAPBO95292 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAPBO95292 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAPBO95292 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAPBO95292 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAPBO95292 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAPBO95292 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAPBO95292 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAPBO95292 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAPBO95292 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAPBO95292 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAPBO95292 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAPBO95292 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAPBO95292 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAPBO95292 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAPBO95292 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAPBO95292 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAPBO95292 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAPBO95292 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAPBO95292 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VAPBO95292 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAPBO95292 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAPBO95292 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAPBO95292 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAPBO95292 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VAPBO95292 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAPBO95292 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAPBO95292 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAPBO95292 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAPBO95292 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAPBO95292 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAPBO95292 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VAPBO95292 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAPBO95292 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAPBO95292 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAPBO95292 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAPBO95292 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAPBO95292 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAPBO95292 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAPBO95292 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VAPBO95292 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAPBO95292 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAPBO95292 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VAPBO95292 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAPBO95292 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAPBO95292 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAPBO95292 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAPBO95292 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms