Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX4O95219 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX4O95219 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX4O95219 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX4O95219 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX4O95219 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX4O95219 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX4O95219 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SNX4O95219 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX4O95219 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX4O95219 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX4O95219 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX4O95219 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX4O95219 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX4O95219 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX4O95219 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX4O95219 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX4O95219 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX4O95219 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX4O95219 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX4O95219 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX4O95219 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX4O95219 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX4O95219 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX4O95219 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX4O95219 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX4O95219 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX4O95219 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX4O95219 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX4O95219 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX4O95219 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX4O95219 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX4O95219 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX4O95219 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX4O95219 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX4O95219 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX4O95219 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX4O95219 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX4O95219 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX4O95219 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX4O95219 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX4O95219 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX4O95219 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX4O95219 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX4O95219 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX4O95219 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX4O95219 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX4O95219 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX4O95219 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX4O95219 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX4O95219 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX4O95219 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX4O95219 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX4O95219 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX4O95219 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX4O95219 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX4O95219 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX4O95219 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX4O95219 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX4O95219 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX4O95219 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX4O95219 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX4O95219 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX4O95219 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX4O95219 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX4O95219 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX4O95219 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX4O95219 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX4O95219 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX4O95219 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX4O95219 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX4O95219 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX4O95219 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX4O95219 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX4O95219 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX4O95219 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX4O95219 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX4O95219 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX4O95219 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX4O95219 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX4O95219 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX4O95219 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX4O95219 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX4O95219 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX4O95219 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX4O95219 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX4O95219 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX4O95219 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX4O95219 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX4O95219 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX4O95219 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX4O95219 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX4O95219 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SNX4O95219 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
SNX4O95219 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX4O95219 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX4O95219 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX4O95219 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX4O95219 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX4O95219 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms