Protein–RNA interactions for Protein: O94876

TMCC1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC1O94876 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMCC1O94876 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms