Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FLOT1O75955 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FLOT1O75955 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FLOT1O75955 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FLOT1O75955 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FLOT1O75955 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FLOT1O75955 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FLOT1O75955 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FLOT1O75955 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FLOT1O75955 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FLOT1O75955 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FLOT1O75955 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FLOT1O75955 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FLOT1O75955 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FLOT1O75955 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FLOT1O75955 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FLOT1O75955 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FLOT1O75955 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FLOT1O75955 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FLOT1O75955 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FLOT1O75955 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FLOT1O75955 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FLOT1O75955 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FLOT1O75955 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FLOT1O75955 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FLOT1O75955 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FLOT1O75955 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FLOT1O75955 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FLOT1O75955 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FLOT1O75955 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FLOT1O75955 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FLOT1O75955 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FLOT1O75955 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FLOT1O75955 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FLOT1O75955 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FLOT1O75955 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FLOT1O75955 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms