Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF3JO75822 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms