Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN15O75808 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN15O75808 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CAPN15O75808 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CAPN15O75808 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN15O75808 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN15O75808 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN15O75808 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN15O75808 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN15O75808 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN15O75808 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN15O75808 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN15O75808 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN15O75808 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN15O75808 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN15O75808 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN15O75808 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN15O75808 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN15O75808 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN15O75808 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN15O75808 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN15O75808 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms