Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB3O75712 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB3O75712 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB3O75712 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB3O75712 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB3O75712 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB3O75712 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB3O75712 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB3O75712 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB3O75712 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB3O75712 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB3O75712 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB3O75712 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB3O75712 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB3O75712 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB3O75712 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB3O75712 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB3O75712 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB3O75712 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB3O75712 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB3O75712 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB3O75712 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB3O75712 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB3O75712 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB3O75712 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB3O75712 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB3O75712 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB3O75712 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB3O75712 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB3O75712 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB3O75712 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB3O75712 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB3O75712 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB3O75712 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB3O75712 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB3O75712 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB3O75712 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB3O75712 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB3O75712 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB3O75712 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB3O75712 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB3O75712 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB3O75712 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB3O75712 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB3O75712 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB3O75712 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB3O75712 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB3O75712 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB3O75712 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB3O75712 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB3O75712 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB3O75712 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB3O75712 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB3O75712 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB3O75712 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB3O75712 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB3O75712 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB3O75712 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB3O75712 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB3O75712 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB3O75712 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB3O75712 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB3O75712 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB3O75712 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB3O75712 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB3O75712 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB3O75712 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB3O75712 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB3O75712 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB3O75712 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB3O75712 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB3O75712 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJB3O75712 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJB3O75712 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB3O75712 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB3O75712 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB3O75712 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB3O75712 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB3O75712 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB3O75712 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB3O75712 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB3O75712 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB3O75712 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB3O75712 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB3O75712 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB3O75712 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB3O75712 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB3O75712 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB3O75712 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB3O75712 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB3O75712 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB3O75712 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB3O75712 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB3O75712 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB3O75712 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB3O75712 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB3O75712 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB3O75712 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB3O75712 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB3O75712 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms