Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NPM3O75607 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NPM3O75607 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NPM3O75607 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NPM3O75607 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NPM3O75607 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NPM3O75607 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NPM3O75607 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NPM3O75607 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NPM3O75607 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NPM3O75607 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NPM3O75607 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NPM3O75607 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NPM3O75607 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NPM3O75607 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NPM3O75607 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NPM3O75607 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NPM3O75607 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NPM3O75607 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NPM3O75607 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NPM3O75607 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NPM3O75607 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NPM3O75607 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NPM3O75607 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NPM3O75607 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NPM3O75607 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NPM3O75607 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NPM3O75607 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NPM3O75607 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NPM3O75607 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NPM3O75607 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NPM3O75607 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NPM3O75607 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NPM3O75607 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NPM3O75607 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NPM3O75607 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NPM3O75607 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NPM3O75607 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NPM3O75607 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NPM3O75607 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NPM3O75607 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NPM3O75607 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NPM3O75607 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NPM3O75607 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NPM3O75607 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NPM3O75607 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NPM3O75607 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NPM3O75607 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NPM3O75607 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NPM3O75607 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NPM3O75607 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NPM3O75607 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NPM3O75607 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NPM3O75607 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NPM3O75607 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NPM3O75607 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NPM3O75607 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NPM3O75607 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NPM3O75607 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NPM3O75607 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NPM3O75607 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NPM3O75607 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NPM3O75607 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NPM3O75607 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NPM3O75607 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NPM3O75607 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NPM3O75607 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NPM3O75607 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NPM3O75607 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NPM3O75607 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NPM3O75607 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NPM3O75607 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NPM3O75607 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NPM3O75607 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NPM3O75607 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NPM3O75607 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NPM3O75607 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NPM3O75607 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NPM3O75607 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NPM3O75607 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NPM3O75607 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NPM3O75607 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NPM3O75607 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NPM3O75607 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NPM3O75607 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NPM3O75607 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NPM3O75607 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NPM3O75607 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NPM3O75607 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NPM3O75607 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NPM3O75607 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NPM3O75607 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NPM3O75607 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NPM3O75607 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NPM3O75607 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NPM3O75607 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NPM3O75607 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NPM3O75607 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NPM3O75607 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NPM3O75607 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms