Protein–RNA interactions for Protein: O75419

CDC45, Cell division control protein 45 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC45O75419 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC45O75419 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC45O75419 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC45O75419 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC45O75419 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC45O75419 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC45O75419 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC45O75419 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC45O75419 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC45O75419 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC45O75419 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC45O75419 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC45O75419 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CDC45O75419 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CDC45O75419 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDC45O75419 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDC45O75419 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDC45O75419 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDC45O75419 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDC45O75419 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CDC45O75419 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDC45O75419 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDC45O75419 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDC45O75419 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDC45O75419 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDC45O75419 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC45O75419 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC45O75419 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC45O75419 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC45O75419 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC45O75419 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC45O75419 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC45O75419 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC45O75419 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC45O75419 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC45O75419 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC45O75419 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDC45O75419 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDC45O75419 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDC45O75419 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDC45O75419 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDC45O75419 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDC45O75419 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDC45O75419 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDC45O75419 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDC45O75419 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDC45O75419 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDC45O75419 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDC45O75419 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDC45O75419 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CDC45O75419 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CDC45O75419 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CDC45O75419 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CDC45O75419 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDC45O75419 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC45O75419 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC45O75419 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC45O75419 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC45O75419 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC45O75419 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC45O75419 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC45O75419 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC45O75419 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC45O75419 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC45O75419 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC45O75419 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC45O75419 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC45O75419 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC45O75419 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDC45O75419 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDC45O75419 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDC45O75419 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDC45O75419 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDC45O75419 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDC45O75419 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDC45O75419 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDC45O75419 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDC45O75419 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDC45O75419 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDC45O75419 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDC45O75419 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDC45O75419 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDC45O75419 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDC45O75419 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDC45O75419 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDC45O75419 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDC45O75419 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDC45O75419 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDC45O75419 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDC45O75419 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDC45O75419 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDC45O75419 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDC45O75419 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDC45O75419 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDC45O75419 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDC45O75419 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDC45O75419 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDC45O75419 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CDC45O75419 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDC45O75419 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms