Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPFIA3O75145 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPFIA3O75145 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms