Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG13O75143 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG13O75143 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG13O75143 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG13O75143 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG13O75143 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG13O75143 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG13O75143 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG13O75143 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG13O75143 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG13O75143 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG13O75143 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG13O75143 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG13O75143 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG13O75143 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG13O75143 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG13O75143 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG13O75143 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG13O75143 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG13O75143 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG13O75143 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG13O75143 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG13O75143 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG13O75143 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG13O75143 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG13O75143 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG13O75143 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG13O75143 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG13O75143 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG13O75143 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG13O75143 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG13O75143 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG13O75143 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG13O75143 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG13O75143 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG13O75143 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG13O75143 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG13O75143 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG13O75143 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG13O75143 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG13O75143 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG13O75143 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG13O75143 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG13O75143 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG13O75143 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG13O75143 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG13O75143 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG13O75143 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG13O75143 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG13O75143 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG13O75143 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG13O75143 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG13O75143 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG13O75143 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG13O75143 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG13O75143 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG13O75143 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG13O75143 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG13O75143 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG13O75143 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG13O75143 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG13O75143 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG13O75143 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG13O75143 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG13O75143 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG13O75143 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG13O75143 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG13O75143 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG13O75143 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG13O75143 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG13O75143 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG13O75143 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATG13O75143 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG13O75143 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG13O75143 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG13O75143 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG13O75143 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG13O75143 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG13O75143 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG13O75143 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG13O75143 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG13O75143 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG13O75143 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG13O75143 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG13O75143 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG13O75143 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG13O75143 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG13O75143 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG13O75143 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG13O75143 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG13O75143 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG13O75143 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG13O75143 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG13O75143 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG13O75143 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG13O75143 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG13O75143 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG13O75143 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG13O75143 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG13O75143 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms