Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBNO60934 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBNO60934 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBNO60934 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBNO60934 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBNO60934 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBNO60934 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBNO60934 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBNO60934 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBNO60934 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBNO60934 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBNO60934 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBNO60934 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBNO60934 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBNO60934 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBNO60934 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBNO60934 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NBNO60934 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NBNO60934 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBNO60934 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NBNO60934 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBNO60934 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBNO60934 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NBNO60934 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NBNO60934 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NBNO60934 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBNO60934 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBNO60934 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBNO60934 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBNO60934 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBNO60934 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBNO60934 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBNO60934 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBNO60934 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBNO60934 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBNO60934 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBNO60934 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBNO60934 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBNO60934 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBNO60934 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBNO60934 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBNO60934 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBNO60934 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBNO60934 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBNO60934 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NBNO60934 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBNO60934 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBNO60934 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBNO60934 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBNO60934 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBNO60934 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBNO60934 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBNO60934 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBNO60934 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBNO60934 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBNO60934 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBNO60934 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBNO60934 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBNO60934 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NBNO60934 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBNO60934 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBNO60934 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBNO60934 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBNO60934 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBNO60934 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBNO60934 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBNO60934 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBNO60934 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBNO60934 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBNO60934 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBNO60934 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBNO60934 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBNO60934 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBNO60934 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBNO60934 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBNO60934 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBNO60934 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBNO60934 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NBNO60934 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBNO60934 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBNO60934 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBNO60934 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBNO60934 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBNO60934 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBNO60934 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBNO60934 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NBNO60934 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBNO60934 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBNO60934 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBNO60934 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBNO60934 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBNO60934 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBNO60934 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBNO60934 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBNO60934 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBNO60934 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NBNO60934 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NBNO60934 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NBNO60934 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NBNO60934 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms