Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC44.62■■■■■ 4.73
ABCC9O60706 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
ABCC9O60706 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
ABCC9O60706 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC44.61■■■■■ 4.73
ABCC9O60706 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC44.61■■■■■ 4.73
ABCC9O60706 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC44.61■■■■■ 4.73
ABCC9O60706 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.61■■■■■ 4.73
ABCC9O60706 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC44.61■■■■■ 4.73
ABCC9O60706 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC44.61■■■■■ 4.73
ABCC9O60706 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
ABCC9O60706 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC44.6■■■■■ 4.73
ABCC9O60706 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC44.6■■■■■ 4.73
ABCC9O60706 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
ABCC9O60706 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
ABCC9O60706 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
ABCC9O60706 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC44.6■■■■■ 4.73
ABCC9O60706 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.6■■■■■ 4.73
ABCC9O60706 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC44.6■■■■■ 4.73
ABCC9O60706 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC44.6■■■■■ 4.73
ABCC9O60706 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC44.6■■■■■ 4.73
ABCC9O60706 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
ABCC9O60706 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
ABCC9O60706 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
ABCC9O60706 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
ABCC9O60706 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.59■■■■■ 4.73
ABCC9O60706 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC44.58■■■■■ 4.73
ABCC9O60706 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
ABCC9O60706 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
ABCC9O60706 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
ABCC9O60706 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
ABCC9O60706 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
ABCC9O60706 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC44.57■■■■■ 4.73
ABCC9O60706 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC44.57■■■■■ 4.73
ABCC9O60706 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC44.57■■■■■ 4.73
ABCC9O60706 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC44.57■■■■■ 4.73
ABCC9O60706 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.57■■■■■ 4.72
ABCC9O60706 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC44.56■■■■■ 4.72
ABCC9O60706 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
ABCC9O60706 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
ABCC9O60706 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
ABCC9O60706 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
ABCC9O60706 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC44.56■■■■■ 4.72
ABCC9O60706 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC44.55■■■■■ 4.72
ABCC9O60706 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
ABCC9O60706 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC44.55■■■■■ 4.72
ABCC9O60706 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC44.55■■■■■ 4.72
ABCC9O60706 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC44.55■■■■■ 4.72
ABCC9O60706 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC44.55■■■■■ 4.72
ABCC9O60706 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.55■■■■■ 4.72
ABCC9O60706 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC44.55■■■■■ 4.72
ABCC9O60706 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC44.55■■■■■ 4.72
ABCC9O60706 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC44.54■■■■■ 4.72
ABCC9O60706 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
ABCC9O60706 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
ABCC9O60706 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC44.54■■■■■ 4.72
ABCC9O60706 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC44.53■■■■■ 4.72
ABCC9O60706 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
ABCC9O60706 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
ABCC9O60706 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC44.53■■■■■ 4.72
ABCC9O60706 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.53■■■■■ 4.72
ABCC9O60706 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
ABCC9O60706 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
ABCC9O60706 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC44.53■■■■■ 4.72
ABCC9O60706 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
ABCC9O60706 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
ABCC9O60706 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
ABCC9O60706 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
ABCC9O60706 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
ABCC9O60706 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC44.52■■■■■ 4.72
ABCC9O60706 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
ABCC9O60706 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
ABCC9O60706 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC44.51■■■■■ 4.72
ABCC9O60706 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC44.51■■■■■ 4.72
ABCC9O60706 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
ABCC9O60706 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC44.51■■■■■ 4.72
ABCC9O60706 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.51■■■■■ 4.72
ABCC9O60706 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.5■■■■■ 4.71
ABCC9O60706 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
ABCC9O60706 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
ABCC9O60706 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.5■■■■■ 4.71
ABCC9O60706 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
ABCC9O60706 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
ABCC9O60706 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC44.5■■■■■ 4.71
ABCC9O60706 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
ABCC9O60706 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
ABCC9O60706 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
ABCC9O60706 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC44.49■■■■■ 4.71
ABCC9O60706 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
ABCC9O60706 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
ABCC9O60706 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC44.48■■■■■ 4.71
ABCC9O60706 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC44.48■■■■■ 4.71
ABCC9O60706 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC44.48■■■■■ 4.71
ABCC9O60706 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC44.48■■■■■ 4.71
ABCC9O60706 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
ABCC9O60706 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
ABCC9O60706 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
ABCC9O60706 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC44.47■■■■■ 4.71
ABCC9O60706 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
ABCC9O60706 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.47■■■■■ 4.71
ABCC9O60706 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms