Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
KLHL41O60662 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL41O60662 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms