Protein–RNA interactions for Protein: O60359

CACNG3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG3O60359 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNG3O60359 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms