Protein–RNA interactions for Protein: O60318

MCM3AP, Germinal-center associated nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3APO60318 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCM3APO60318 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MCM3APO60318 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MCM3APO60318 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MCM3APO60318 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MCM3APO60318 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MCM3APO60318 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MCM3APO60318 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM3APO60318 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM3APO60318 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM3APO60318 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM3APO60318 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM3APO60318 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM3APO60318 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM3APO60318 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM3APO60318 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM3APO60318 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM3APO60318 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM3APO60318 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM3APO60318 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM3APO60318 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM3APO60318 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM3APO60318 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM3APO60318 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM3APO60318 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM3APO60318 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM3APO60318 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM3APO60318 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM3APO60318 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM3APO60318 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM3APO60318 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCM3APO60318 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCM3APO60318 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCM3APO60318 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCM3APO60318 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCM3APO60318 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCM3APO60318 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MCM3APO60318 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCM3APO60318 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCM3APO60318 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCM3APO60318 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCM3APO60318 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCM3APO60318 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCM3APO60318 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MCM3APO60318 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCM3APO60318 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms