Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ATP10AO60312 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ATP10AO60312 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ATP10AO60312 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ATP10AO60312 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ATP10AO60312 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ATP10AO60312 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ATP10AO60312 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ATP10AO60312 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ATP10AO60312 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ATP10AO60312 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ATP10AO60312 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ATP10AO60312 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ATP10AO60312 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ATP10AO60312 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ATP10AO60312 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ATP10AO60312 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ATP10AO60312 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ATP10AO60312 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ATP10AO60312 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ATP10AO60312 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ATP10AO60312 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ATP10AO60312 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ATP10AO60312 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ATP10AO60312 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ATP10AO60312 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ATP10AO60312 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ATP10AO60312 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ATP10AO60312 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ATP10AO60312 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ATP10AO60312 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ATP10AO60312 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ATP10AO60312 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ATP10AO60312 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ATP10AO60312 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
ATP10AO60312 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ATP10AO60312 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ATP10AO60312 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ATP10AO60312 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ATP10AO60312 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ATP10AO60312 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
ATP10AO60312 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ATP10AO60312 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
ATP10AO60312 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
ATP10AO60312 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ATP10AO60312 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ATP10AO60312 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ATP10AO60312 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ATP10AO60312 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ATP10AO60312 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ATP10AO60312 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
ATP10AO60312 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ATP10AO60312 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms