Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BNIP3LO60238 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms