Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GATCO43716 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GATCO43716 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GATCO43716 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GATCO43716 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GATCO43716 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GATCO43716 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GATCO43716 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GATCO43716 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GATCO43716 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GATCO43716 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GATCO43716 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GATCO43716 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GATCO43716 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GATCO43716 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GATCO43716 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GATCO43716 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GATCO43716 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GATCO43716 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GATCO43716 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GATCO43716 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GATCO43716 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GATCO43716 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GATCO43716 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GATCO43716 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GATCO43716 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GATCO43716 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GATCO43716 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GATCO43716 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GATCO43716 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GATCO43716 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GATCO43716 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GATCO43716 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GATCO43716 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GATCO43716 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GATCO43716 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GATCO43716 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GATCO43716 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GATCO43716 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GATCO43716 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GATCO43716 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GATCO43716 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GATCO43716 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GATCO43716 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GATCO43716 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GATCO43716 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GATCO43716 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GATCO43716 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GATCO43716 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GATCO43716 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GATCO43716 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GATCO43716 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATCO43716 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATCO43716 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATCO43716 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATCO43716 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATCO43716 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATCO43716 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATCO43716 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATCO43716 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATCO43716 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATCO43716 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATCO43716 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATCO43716 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATCO43716 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GATCO43716 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATCO43716 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATCO43716 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATCO43716 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATCO43716 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATCO43716 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATCO43716 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATCO43716 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATCO43716 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATCO43716 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATCO43716 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATCO43716 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATCO43716 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATCO43716 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATCO43716 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATCO43716 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATCO43716 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATCO43716 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATCO43716 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATCO43716 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATCO43716 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATCO43716 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATCO43716 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATCO43716 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATCO43716 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATCO43716 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATCO43716 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATCO43716 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATCO43716 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATCO43716 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATCO43716 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATCO43716 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATCO43716 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATCO43716 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATCO43716 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms