Protein–RNA interactions for Protein: O43709

BUD23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD23O43709 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BUD23O43709 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BUD23O43709 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BUD23O43709 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BUD23O43709 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BUD23O43709 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BUD23O43709 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BUD23O43709 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BUD23O43709 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BUD23O43709 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BUD23O43709 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BUD23O43709 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BUD23O43709 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BUD23O43709 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BUD23O43709 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BUD23O43709 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BUD23O43709 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BUD23O43709 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BUD23O43709 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BUD23O43709 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BUD23O43709 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BUD23O43709 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BUD23O43709 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BUD23O43709 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BUD23O43709 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BUD23O43709 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
BUD23O43709 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BUD23O43709 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BUD23O43709 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BUD23O43709 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BUD23O43709 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BUD23O43709 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BUD23O43709 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BUD23O43709 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BUD23O43709 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BUD23O43709 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BUD23O43709 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BUD23O43709 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BUD23O43709 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BUD23O43709 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BUD23O43709 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BUD23O43709 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BUD23O43709 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BUD23O43709 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BUD23O43709 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BUD23O43709 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BUD23O43709 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BUD23O43709 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BUD23O43709 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BUD23O43709 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BUD23O43709 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BUD23O43709 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BUD23O43709 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BUD23O43709 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BUD23O43709 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BUD23O43709 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BUD23O43709 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BUD23O43709 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BUD23O43709 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BUD23O43709 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BUD23O43709 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BUD23O43709 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BUD23O43709 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BUD23O43709 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BUD23O43709 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BUD23O43709 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BUD23O43709 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BUD23O43709 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BUD23O43709 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BUD23O43709 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BUD23O43709 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BUD23O43709 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BUD23O43709 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BUD23O43709 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BUD23O43709 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BUD23O43709 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BUD23O43709 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BUD23O43709 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BUD23O43709 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BUD23O43709 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BUD23O43709 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BUD23O43709 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BUD23O43709 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BUD23O43709 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BUD23O43709 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BUD23O43709 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BUD23O43709 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BUD23O43709 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BUD23O43709 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BUD23O43709 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BUD23O43709 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BUD23O43709 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BUD23O43709 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BUD23O43709 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BUD23O43709 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BUD23O43709 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BUD23O43709 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BUD23O43709 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BUD23O43709 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BUD23O43709 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms