Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRGAP3O43295 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms