Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SGSM2O43147 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms