Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN3O15551 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms